Το λιμάνι του Πειραιά είναι το κύριο λιμάνι της Αθήνας/Ελλάδας με υπηρεσίες σε διεθνείς προορισμούς καθώς και τα νησιά του Αργοσαρωνικού (Ύδρα, Σπέτσες, Πόρο, Αίγινα και Σαλαμίνα), το Αιγαίο (Κυκλάδες, Δωδεκάνησα) και της Κρήτης. Δεν εξυπηρετεί τα νησιά των Σποράδων.
Ο Άγιος Κωνσταντίνος λιμάνι είναι το μόνο λιμάνι Αθήνας που έχει δρομολόγια για τα νησιά των Σποράδων (Σκόπελο, Σκιάθο, Σκύρο και Αλόννησο).
Το λιμάνι του Λαυρίου προσφέρει όλο το χρόνο υπηρεσίες σε Κέα, Κύθνος, Σύρος, Τήνος, Άνδρος, Ίος, Σίκινος, Φολέγανδρος, η Μήλος, η Πάρος, η Νάξος, Λήμνος, Άγιο Ευστράτιο και την Καβάλα.
Το λιμάνι της Ραφήνας για Άνδρο, Τήνο, Μύκονο, Μαρμάρι και την Εύβοια. Το καλοκαίρι υπάρχει μια πρόσθετη υπηρεσία στη Σύρο, τη Νάξο.